Das enge Tal der Kamnitzbaches ist reich an verschiedenen Pilz-, Algen-, Blaualgen- und Moosarten. Die Artenvielfalt ist durch optimale Lebensbedingungen – wie feuchtes Klima, und Wasser – gegeben.

Aus Sicht der Pilzkunde gehört die Kamnitzklamm zu den bedeutungsvollen im Land. Es wurde hier eine große Menge von niederen und höheren Pilzarten festgestellt. Bedeutungsvoll ist das Vorkommen von Phellinus nigrolimitatus, die an Fichtenstämmen vorkommt. Diese Art kommt in der Tschechischen Republik sonst ausschließlich in ursprünglichen Fichtenbeständen in einer Höhe von rund 800 Meter vor. Ihr hiesiges Vorkommen bestätigt die Annahme, dass die Gemeine Fichte hier in der Klamm, die stellenweise ein Gebirgsklima aufweist, heimisch ist. Eine Seltenheit ist der Fund des Pilzes Gelerina saxicola im Jahre 1994.